A bioinformatika egyetemi tanára a Pázmány Péter Katolikus Egyetemen és a trieszti International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology Fehérjeszerkezeti és Bioinformatikai részlegének vezetője. Az Európai Bioinformatikai Szövetség, az EMBnet választott elnöke (1996-1997), a gödöllői MBK Fehérjekutató intézetének igazgatója (1990-1994). Az MTA és az Academia Europaea tagja. Érdeklődési területe a bioinformatika és a fehérje-kutatás. 275 közleménye jelent meg, H-indexe 38.

Web: http://pongor.itk.ppke.hu/http://net.icgeb.org/pongor/