Daganatok kialakulásához vezető fehérjehálózatok feltérképezése
Egy közelmúltban általunk fejlesztett protokoll lehetővé teszi kisméretű szövetbiopsziák tömegspektrometrián alapuló proteomikai és glikomikai vizsgálatát. Célunk a daganat kialakulásához vezető főbb fehérje hálózatok feltérképezése egészséges és dagantos szöveti mikroarray (TMA) minták proteomikai vizsgálatán keresztül. A szöveti mikroarray-ek (TMA) számos betegtől származó 2 mm átmérőjű szövetbiopsziákat tartalmaznak sorba rendezve. Tervünk egy pilot study keretében különböző típusú szövetekben (prosztata-, tüdő- és emlőszövet) meghatározni a rákos és az egészséges állapot közötti különbségeket. Ehhez vizsgálati mintaként kereskedelmi forgalomban kapható TMA-kat alkalmazunk. A pilot study során azt a kérdést kívánjuk megválaszolni, hogy különböző típusú dagantok kialakulásban melyek az azonos, és melyek a rák típusától függő főbb különbségek. Ennek megválaszolására a statisztikailag szignifikáns változást mutató fehérjékkel fehérje hálózatokat építünk. A proteomikai vizsgálatokat kiterjesztjük a foszforiláció vizsgálatára, melyek fontos szabályozó szerepe jól ismert. A mintaelőkészítés során a foszfopeptidek dúsítása szükséges, melyre számos irodalmi módszer alkalmazható, azonban a rendkívül kis mintamennyiség miatt a módszerfejlesztés elengedhetetlen. A kutatás kiindulópontja lehet új típusú diagnosztikai módszerek kifejlesztésének, valamint új terápiás célpontok azonosításának is.
Turiák Lilla, Nyitray László