S100 fehérje-fehérje kölcsönhatások specificitási térképe
Az S100 fehérjék gerincesekben előforduló, 20 tagú családot alkotó kalciumion szenzorok, amelyek célfehérjékhez kötődve fejik ki hatásukat. Fiziológiás szerepük többnyire tisztázatlan, azonban számos kóros esetben (tumorok, fibrózisok, gyulladások) figyelték meg túltermelődésüket. Kölcsönhatásaik plasztikusak, egy partner általában több S100-hoz is képes kötődni. Együttműködésünk célja, hogy meghatározza az S100 család interaktomját és a családon belüli specifitásprofilokat. Ezt egyelőre nem teszi lehetővé, hogy az előkísérleteink és szakirodalom alapján az eddig azonosított partnerek az S100 fehérjék kb. 2/3-ához képesek kötődni, míg a maradékhoz nem ismerünk egyetlen partnert sem. Mivel így csak torzított specifitási térképet tudunk csak létrehozni, ezért a pályázat keretében tömegspektrometriás módszerekkel (AP/TAP-MS) tervezzük az S100 interaktomot kiegészíteni, közel teljessé tenni. Rekombináns S100 fehérjék alkalmazásával a kötőpartnereket affinitáskromatográfiás módszerrel izoláljuk sejtlizátumból. A fehérjék azonosítása tripszines hasítást követő LC-MS/MS szekvenálással és adatbáziskereséssel történik. Az azonosított kötőpartnereket biokémiai módszerekkel és sejtes kísérletekben vizsgáljuk, az érdekesebb komplexek szerkezetét is meghatározzuk és további funkcionális vizsgálatokat is tervezünk velük. Hosszabb távon kísérleteink eredményei S100-alapú gyógyszertervezéshez is elvezethetnek.
Nyitray László, Schlosser Gitta, Turiák Lilla